在日本這個國家的黑暗裡,有鬼怪棲息著──還有,這黑暗的以神劍除魔的人…… 人世間混亂時,鬼就開始跋扈了！在幕府末期,動亂的時代,因為過激派浪士和暗夜裡的鬼關係,首都一片腥風血雨,化成了殺戮之都,因此,幕府為了鎮壓浪士,設立武裝軍事警察「新撰組」。然後針對暗夜裡的「鬼」,帶著神劍前往暗夜裡除魔的人……組織了「神劍組」！