在東京地底深處; 竟隱藏著不可告人的秘密城市…… 留美奈一直嚮往升上高中后能過著和平的「薔薇色生活」,但在入學的第一天就得罪了前輩,放學后在家裡更遇上兩個被人追殺的女孩。 原來在東京地底有一個被遺忘了、被封印著的「東京地底城」,其中被稱為「生命巫女」的琉璃因擁有令人起死回生的能力而被神秘組織追捕。 其後留美奈因保護她而戰死,琉璃用法力令他重生,留美奈更因而得到了「風」的能力,一種連地底的人也未能掌握的能力……