故事背景要從21世紀初開始講起,由於人類科技的進步導致的世界大戰,還有因其造成的環境的污染,讓人類開始航向宇宙中展開新的生活,並開啟了「星歷00年」的世代。而根據統治者「超銀河聯合」的法令,演藝圈與歌曲等會混亂人心的東西都是被禁止的,甚至也進行了嚴格的取締和懲罰,為此偶像們的身影也就逐漸消失在大家的眼前,人類的心靈也被逐漸黑暗籠罩……。　　而就在「偶像」這種存在幾乎要滅絕的時候,名為「AKB0048」的偶像團體復活 誕生了。那是過去在地球面臨存亡之戰時,點亮人心、並歌唱、舞動至最後一刻的偶像團體「AKB48」的后繼者。AKB0048繼承了他們的靈魂,以非法偶像的名號登場！　　既然是非法,所以當然也無法舉辦公開的演唱會……,但是在這演藝行為被禁止的時代,更顧不得危險,她們強行前往粉絲們的所在、並為大家展開了表演。這個時代的「AKB」已經從「想看就可以去看的偶像」進化成為「會前來表演給你看的偶像」！由愛漫畫收集自網際網路－愛漫畫,讓你愛上漫畫！在這個黑暗的世界中,她們將以「奇跡的演唱會」為失去夢想的人們帶來充滿希望的未來。　　但是,壓倒性的影響力也襲向這些女孩們,無視於聯合政府進行活動的她們,理所當然就被認定為是恐怖份子,為了保護自己的舞臺還有粉絲和大家的希望,她們將拿起武器戰斗。「只要還有粉絲在的一天,就算受傷倒下我們也會繼續戰斗,我們將不會停止唱歌！」　　而時間來到了星歷0048年,在這個命運般的一年,展開了第77屆的研究生的故事,在這些女孩中能夠成為新的希望之星,站上舞臺的是誰？全新的偶像故事就要從這里開始！