游戲王5DS漫畫是由全新的游戲王動畫改編而成。故事的舞臺就是武藤游戲等人曾經活躍過的、幾十年後的童野鎮。在未來的童野鎮擁有最新式設備的體育場中,流行的是一種以騎乘最先進的決斗卡片,通過賽車的形式進行比賽的「Riding Duel」,故事就是以新主角—不動遊星展開的…… 游戲王5DS漫畫以游戲所在時代的數十年後的未來世界為舞臺,地點在「童實野町」,講的是 18歲的主角不動遊星集結5龍卡的全新故事！在游戲王5DS的時代,十分流行以騎乘型最新決斗盤進行的高速決斗！遊星與使用決斗盤和卡片游戲組合的競技之王傑克?阿特拉斯進行對決。另外還有一旦戰斗就會發揮出超能力的謎般少女十六夜,以及仰慕遊星的雙生子：哥哥龍亞與妹妹龍可,從小就投入到了激戰中去。他們會為大家帶來什麼樣的精彩戰斗場面呢？