故事舞臺是在距今為止遙遠的未來,地上的生物沉入海底,被海底的微小生物所食變成無機物,經過長時間的結晶最終變成了寶石生命體一樣的存在。擁有寶石身體的28人,為了抵抗打算將寶石人作為裝飾的「月人」,而各自分配了戰斗和醫療方面的職責。 一心打算和月人戰斗,但卻沒有分配到任何職業的磷葉(Phosphophyllite),被統領著寶石人的金剛先生拜託「編寫博物志」。這時候他遇到了真正擁有強大實力,卻因為會散發毒液,而被其他寶石人敬而遠之的辰砂(硫化汞),自此展開的故事……