五河士道只是一名普通的高校二年生,然而在在四月十日,隨著一場奇怪的大爆炸,一名身穿盔甲手持大劍的神秘少女出現在了他的面前。這名少女的正體是「精靈」,是會給世界帶來災難的存在,而這名少女也正遭到對精靈部隊·AST的攻擊。於是,有著會去幫助有困難、悲傷的人的溫柔性格的士道,主動提出要與精靈進行交涉的任務,隨后,世道發現了自己擁有的特殊體質,那就是通過接吻,來吸收並封印精靈的力量,並且將精靈受到致命傷恢復再生的能力。