斯坦福事件后,康涅狄格州在一場電視直播的新戰士對一群危險的罪犯的戰斗中毀掉了,公眾開始反對超級英雄。Johnny Storm,火焰人,在一家夜店外被攻擊,毆打至昏迷。激進議員再次開始活動,一個超級英雄注冊法案開始進行決議,它要求所有擁有超常人能力的人向政府注冊,向權力部門告知自己的真實身份,並以一個聯邦探員的標準接受訓練和約束。一周后,法案通過。任何擁有超人類力量但拒絕注冊的人被視為罪犯。有些英雄,例如鐵人,認為這是超級英雄在社會中扮演的角色的自然進程,一個合理的要求。另一些人認為這法案是對公民權利的侵犯。在被要求抓捕英雄以保護注冊法案后,美國隊長潛入地下並開始組織抵抗活動。超級英雄社會分裂了。以前的隊友、戰友、朋友發現他們站在內戰的兩邊。鐵人和美國隊長從最緊密的同伴變成了敵對軍隊的領袖。一場大戰中,比爾·福斯特,又稱歌利亞,被一個站在贊成注冊派方面的索爾克隆體殺死了。兄弟拿起武器揮向兄弟,而現在,血也被灑出……