故事發生在二十一世紀末的日本。魔法,這不是一個傳說,而是現代科學的一項技術。它被應用至今已經過了一個世紀。曾經被稱為「超能力」的先天具有的能力被以「魔法」這個名字的體系替代,高超的魔法師被認為是國家的實力。西歷 2095 年的春天,新生入學的季節。國立魔法大學附屬第一高校——通稱「魔法科高校」,是由成績優秀的「一科生」,和作為一科生替補的「二科生」所構成,他們也各自被冠上了「花冠（bloom）」,以及「雜草（weed）」之名。就在這樣的魔法科高校里,一對兄妹入學了。 來訪者篇,開幕！